Ключевое слово надо указывать с большой или маленькой буквы?

Запросы в Яндексе в большинстве случаев не чувствительны к регистру, поэтому нет разницы. Однако, если Вы сомневаетесь проверьте через поиск один и тот же запрос изменив написание ключевого запроса, если ТОП меняется, то продвигать такие запросы лучше всего отдельно.

Вы можете вручную проверить выдачу с большой и маленькой буквы по одному и тому же ключевому слову. Пример выдачи при запросе с большой буквы: