Куда уходят 3000 рублей с баланса, если настройка бесплатная?

3000 рублей не списываются с баланса, а только блокируются на время выполнения работ по настройке. Когда настройка будет завершена, сумма в полном объеме будет выведена из блока на баланс аккаунта и вы потратите ее только на рекламу своих проектов.